La FENADEB oriente ses actions premièrement aux enfants et aux  jeunes ; ce sont les principaux bénéficiaires. Etant donné que c’est un organe fédérateur, la mise en œuvre des actions de la FENADEB à l’exception des actions de plaidoyer de haut niveau, se fait aussi à travers la participation ses bénéficiaires. Comme les statuts le montrent clairement, la fédération est appelée à faire un plaidoyer en faveur de ses organisations membres et de renforcer leurs capacités pour mieux contribuer à la promotion et protection des droits des enfants et des jeunes burundais. 

La FENADEB affronte tous les problèmes sociaux qui peuvent constituer un frein ou une limitation au respect holistique des droits de l’homme en général et de l’enfant en particulier. Elle travaille étroitement avec l’administration nationale, les communautés et les bénéficiaires de ses interventions pour trouver des solutions pratiques et durables en vue d’une pérennisation de la paix et de la concorde sociale, qui sont le reflet du respect des droits de l’homme et de l’enfant.